In un'estate dei nostri giorni il giovane Elio, disilluso e afflitto da un male che sembra incurabile, intraprende un viaggio alle isole Eolie insieme a Costanza, conosciuta solo un mese prima. A Stromboli l'incontro con Lira, che sarà la sua nuova compagna di viaggio, porterà un processo di cambiamento nel mondo interiore del protagonista, nel modo di affrontare la vita e il suo male. Durante il soggiorno nell'arcipelago Elio è trascinato in un labirinto di amore, misteri e scoperte che lo spingerà a riflettere sulla sua esistenza.