Amigasa è un'organizzazione che controlla l'intera umanità in un mondo dove i funghi sono in cima alla catena alimentare. Nell'area D-18 addestra i suoi soldati, tutti parte di una "mente alveare", con una sola eccezione: Dante, anche se non sa leggere, è un ragazzo curioso che non reprime le proprie emozioni e dice sempre quello che pensa. Considerato un'anomalia da Amigasa, viene comunque tenuto in vita per le sue eccezionali capacità fisiche. Un giorno, durante la sua prima missione segreta al di fuori dell'area D-18, l'intera unità di Dante viene distrutta e lui rimane l'unico sopravvissuto. In questa occasione, l'incontro con una donna di nome Aoi ispira il soldato a cambiare il destino da automa che è stato programmato per lui... Fallito il piano, il fronte di Ether ha perso ogni cosa. Nonostante tutto, seguendo la flebile visione di un futuro di speranza, Grant, Dante e gli altri si lanciano in una fuga disperata. Tuttavia, ad attenderli nel luogo in cui sono stati condotti, troveranno qualcosa di spaventoso, che metterà alla prova lo stesso desiderio di sopravvivenza dell'umanità.