Intorno al 1775, Rosario, il monaco curatore della biblioteca del monastero benedettino di San Nicolò l'Arena di Catania, sparisce improvvisamente; l'abate incarica il priore di indagare. Ai giorni nostri, Andrea, un borsista dell'Istituto Superiore Conservazione e Restauro di Roma, si reca al monastero per sviluppare un progetto di restauro dell'organo settecentesco. Insieme a Chiara, una studentessa universitaria, seguirà le tracce di un segreto occultato per oltre due secoli fra le mura del monastero, fra suggestioni magiche e indagini scientifiche. In questo percorso, Andrea si confronterà con Chiara, cercando di capire cosa quella ragazza rappresenti per lui.