Cesenatico, 6 settembre 1502. Leonardo da Vinci comincia il lavoro di ricognizione e misurazione del porto-canale commissionatogli al castello di Cesena da Cesare Borgia. Qui entra fortunosamente in possesso di una serie di pergamene e mappe scampate a un naufragio, contenenti informazioni e disegni per comprendere il cosiddetto Secretum. Rimini, oggi. Coinvolto in un misterioso caso tra Londra e Cesenatico riguardante l'assassinio di un informatore, il commissario capo Elia Laghi porta alla luce inquietanti risvolti sulla storia locale. Una misteriosa lettera indirizzata a George G. Byron da Percy B. Shelley durante il loro soggiorno a Ravenna, apre la via a una incredibile serie di ricerche relative al cosiddetto Secretum. Scienza di frontiera, enigmi del passato e del presente si fondono in "Secretum. Il codice L", illuminando la storia e la cultura della Romagna.